Antiguo apellido catalán, extendido por el Reino de Valencia y quizá derivado del de «Colom», puesto que hay testimonios que, como a éste, le hacen originario de la Provenza y tiene armas muy parecidas a las de dicho linaje y a las de «Coloma», que también parece dimanado de «Colom».

Mossèn Jaime Febrer confirma este origen provenzal del apellido Colomer, diciendo que Guillermo Colomer, que vino de Carlades (pequeña comarca de Francia, que perteneció al Condado de Provenza), sirvió de soldado aventurero en Burriana y en la conquista de toda La Plana. Pasó después a Valencia, Silla y Sollana, y cerca de la villa de Picassent apresó a dos grandes manadas de bueyes y mulos. Por último, fue heredado por el rey don Jaime I de Aragón en la villa de Ontinyent.

Por real decreto de 9 de enero de 1691 fue concedido el título de marqués de Colomer a don Francisco Colomer de Borja. En 1751 lo heredó otro Francisco Colomer. En 1853 pasó a Joaquín Mergelina y Selva, y en 1905 lo heredó doña María Magdalena Mergelina y Marco, que casó en Valencia con N. Ferrándiz.